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RASSF1A基因甲基化——续写肺癌鉴别诊断新篇章2019-04-30 16:32
DNA甲基化是常见的表观遗传学现象,甲基化导致的抑癌基因失活被证实是肿瘤发生发展的主要原因。前面我们介绍过,小小的SHOX2基因甲基化即与肺癌有着千丝万缕的联系,着实令人咋舌。今天,我们的主角是肺癌另一关键基因,SHOX2的好搭档——RASSF1A基因。RASSF1A又有着什么样的甲基化故事呢?我们一起来看看…… RASSF1A基因的功能 RASSF1A基因是Dammann等人[1]于2000年首次从肺癌细胞株中筛选得到的基因。由于其表达产物与小鼠RAS效应蛋白高度同源,因而被命名为RAS相关区域家族1( RAS association domain family 1,RASSF1) ,RASSF1A是其中一个亚型(主要有A,B,C3个亚型)。RASSFIA一般被认为是一种抑癌基因,其编码蛋白通过抑制Ras的活化从而抑制肿瘤形成。该基因的甲基化失活在多种人类肿瘤的发生发展过程中起着重要作用。 RASSF1A基因启动子区域甲基化与肿瘤 人类肿瘤中的RASSF1A基因表达缺失是一个普遍事件,目前已在至少37种肿瘤中发现了RASSF1A启动子的甲基化失活[2-3]。 Saelee等[2]在对肝细胞癌的研究中发现了RASSF1A的高甲基化,且甲基化程度与患者的预后和生存时间显著相关。 Malpeli等[3]发现,80%(16/20)的胰腺癌组织存在RASSF1A甲基化。 此外,Nobuki在甲状腺癌TNM各期也都发现了RASSF1A超甲基化导致的表达缺失,且肿瘤的侵袭性与甲基化程度呈正相关[4-5]…… 言归正传,那么RASSF1A基因在肺癌中又有什么样的表现呢? RASSFIA基因启动子区域甲基化与肺癌发生密切相关 David G. Burbee[6]的研究发现RASSF1A基因在乳腺/肺正常上皮细胞中有表达,在非小细胞肺癌和乳腺癌细胞系中均不表达。同时RASSF1A启动子高甲基化在100%的小细胞肺癌细胞系(SCLC)、63%的非小细胞肺癌细胞系(NSCLC)、64%的乳腺癌细胞系、30%的原发性NSCLC和49%的原发性乳腺肿瘤中能被检测到,而在正常的上皮细胞中均未有检出。由此表明可见,RASSF1A是一种潜在的肿瘤抑制基因,通过启动子区域的高甲基化,在肺癌和乳腺癌中经历表观遗传失活。 M.A. vander Drift[7]对28例肺癌患者及68例对照的痰液样本进行了RASSF1A甲基化检测,检测结果显示,肺癌患者痰液脱落细胞中的RASSF1A基因甲基化水平明显高于对照组。 Qiang Lin等[8]采用甲基化特异性PCR(MS-PCR)方法,对I期NSCLC组织及良性病变组织样本中的多种抑癌基因进行甲基化检测。结果表明,RASSF1A、APC、ESR1、ABCB1和HOXC9基因甲基化在I期非小细胞肺癌组织和良性病变组织中的表达具有显著性差异,且在I期非小细胞肺癌组织中的诊断灵敏度达到79.8%,特异性73.1%。 Yunfei Ma等[9]采用QD-based FRET技术对50例肺癌患者的癌组织和癌旁组织进行甲基化检测,表明癌组织样本PCDHGB6、HOXA9、RASSF1A基因启动子甲基化水平明显高于癌旁组织样本;同时将该检测方法用于无创性样本(支气管刷检样本)的检测,结果表明,RASSF1A通过与其他基因的联合检测,对组织样本的诊断灵敏度可高达92%,在支气管刷片样本中的诊断灵敏度可达到82%。 此外,具体到不同的肺癌亚型,Tomizawa等的研究显示,RASSF1A基因在腺癌(72.4%)中的甲基化频率比在鳞癌(45.1%)中更高。 RASSFIA同其它基因甲基化联合检测在肺癌诊断中的应用 从以上研究可以看出,RASSF1A基因已被证实是典型的抑癌基因,其与肺癌的发生密切相关。RASSF1A基因甲基化在肺癌,尤其是肺腺癌中具有较高的阳性率,而这恰好弥补了SHOX2基因在腺癌中灵敏度的不足。可见,RASSF1A+ SHOX2或许是个更加的策略! 可喜的是,RASSF1A与SHOX2基因的组合联检的优势不仅得到证实,而且已成功实现了商业化(人SHOX2、RASSF1A基因甲基化DNA检测,CFDA20173403354,透景生命)。与传统细胞学相比,SHOX2、RASSF1A双基因甲基化联合检测对不同病理分期、不同病理分型的肺癌诊断均有很高的检测灵敏度,在肺泡灌洗液中的检测灵敏度达到71.5-83.2%,特异性达到90.0-97.4%[11-13]。 下一篇: 如何优雅淡定的进行粪便检测?
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